محمد خاتمی٬ رییس‌جمهوری اسبق در دیدار با نمایندگان تشکل‌های دانشجویی ایران ضمن اشاره به آن‌که «حوزه» و «دانشگاه» نمی‌توانند «یکی» شوند٬ تصریح کرد که «اما می‌توانند اهداف مشترک داشته باشند».
خاتمی گفت: «حوزه و دانشگاه که نمی توانند یکی شوند؛ نه دانشگاه می تواند در ذیل حوزه تعریف شود و نه حوزه می تواند با دانشگاه ادغام شود؛ رسالت آنها با هم متفاوت است اما اهداف مشترک می توانند داشته باشند. حوزه می تواند از دانش روز و موضوع شناسی دانشگاه استفاده کند و احکام متناسب بیاورد و دانشگاه می تواند از حوزه که مبلغ روح اسلام است، بهره ببرد و حوزه باید روح اسلام که عبودیت حق تعالی و اخلاق و انسانیت و عدالت است را بشناسد و بشناساند. رسالت حوزه سنگین است تا همسویی حوزه و دانشگاه در مسیر بهبود جامعه تامین شود».
وی در ادامه در حالی که خود را مدافع «ارزش‌های نظام» و حرکت در «چارچوب قانون اساسی» توصیف کرد٬ اظهار داشت که در گفت‌وگو با طرف مقابل «باید به این نتیجه برسیم که امنیت کشور را با ایجاد فضای امنیتی نمی‌توان تامین کرد».