محمدجعفر منتظری٬ رییس دیوان عدالت اداری٬ در گفت‌وگویی خبر از آن داد که محاکمه برخی نظامیان و اعضای سپاه پاسداران را با اجازه آیت‌الله خمینی انجام می‌داده.
وی که در دهه ۶۰ حاکم شرع سپاه پاسداران بود٬ گفت: «پرونده‌های سپاه اعم از جرایم عمومی و نظامی را با اجازه امام خمینی(ره) بررسی و حکم صادر می‌کردیم».
منتظری گفت که ایران در زمان جنگ «دادگاه صحرایی» نداشت٬ بلکه: «در مراکز استانهای جنگی دادگاه های قضایی ویژه نیروهای مسلح فعال بود. اما گاهی از اوقات اقتضا می کرد این دادگاه ها در خود جبهه تشکیل می شد. این حوادث یا تخلفات ناشی از خطای یک نظامی بود».
به گفته منتظری «در دوران جنگ در میان جرایم و مجازات‌ها اجرای حکم اعدام هم داشتیم. البته مراحل قانونی باید طی می‌شد و دیوان عالی باید حکم نهایی را صادر می‌کرد٬ اما بسیار محدود بود».