محمدعلی نجفی٬ سرپرست وزارت علوم٬ پیش از پایان جلسه رای اعتماد مجلس به محمد فرهادی٬ گزینه پیشنهادی وزارت علوم٬ از این وزارتخانه خداحافظی کرد.
ایرنا٬ خبرگزاری رسمی جمهوری‌اسلامی٬ نوشت: «سرپرست وزارت علوم، تحقیقات و فناوری با صدور پیامی از تمامی مسئولان و کارکنان این وزارتخانه و همچنین دانشگاه ها، مراکز آموزش عالی، پژوهشی و پارک های علم و فناوری در مدت زمان تصدی این وزارتخانه تشکر و قدردانی کرد».
نجفی در پیام خود با اشاره به این‌که «اکنون که تقدیر، موافق تدبیر شده و هنگام وداع فرا رسیده است»، نوشت که در سه ماه گذشته «از سر احساس تکلیف و ادای دین به دولت تدبیر و امید و جامعه علمی کشور» در وزارت علوم حضور داشته.
حکم سرپرستی نجفی بر وزارت علوم تا ۲۹ آبان ماه اعتبار داشت که این حکم با درخواست حسن روحانی و حکم حکومتی آیت‌الله خامنه‌ای تمدید شده بود. نجفی پس از استیضاح رضا فرجی‌دانا به این سمت انتخاب شد و به گفته‌ی خود وی٬ در این مدت پیشنهادهای حسن روحانی برای تصدی پست وزارت علوم را نپذیرفت.