جبار کوچکی‌نژاد٬ عضو کمیسیون آموزش و تحقیقات مجلس شورای اسلامی در گفت‌وگو با خبرگزاری تسنیم با اشاره به استیضاح وزیر علوم تصریح کرد که رییس‌جمهوری نیز به فرجی‌دانا «معترض» است.
کوچکی‌نژاد در این باره گفت: «وزیر علوم در خصوص انتخاب رؤسای دانشگاه‌ها وزیر علوم به گونه‌ای عمل کرد که مورد اعتراض آقای روحانی رئیس جمهور قرار گرفت و وی گله‌مندی خود را به وزیر اعلام کرد ضمن اینکه شورای عالی انقلاب فرهنگی نیز به آقای فرجی دانا نسبت به این موضوع تذکر داد».
کوچکی‌نژاد افزود: «متأسفانه وزیر علوم در بحث انتصابات نتوانسته است بدون گرایشات تند سیاسی در مدت مدیریت خود به تعهداتش عمل کند و بسیاری از انتصاباتی که آقای فرجی دانا داشته است شدیداً از جریانات سیاسی متاثر بوده است».