وب‌سایت آیت‌الله خامنه‌ای، رهبر جمهوری‌اسلامی در یادداشتی اقدام به تحلیل مواضع وی درباره توافق هسته‌ای کرد و نوشت که از نظرخامنه ای متن توافق خیانت نبوده، اما تایید هم نشده است. حسین شریعتمداری نیز در سرمقاله امروز روزنامه کیهان به همین مساله اشاره کرده است.
وب‌سایت دفتر آیت‌الله خامنه‌ای در یادداشتی به انتقاد از برخی مخالفان گفت‌وگوهای هسته‌ای پرداخته که “تیغ انتقاد خود را به نحوی به سمت تیم مذاکره‌کننده برده‌اند که گویی متن جمع‌بندی جز با خیانت آنها آماده نشده است” و چنین رویکردی را خلاف نظر آیت‌الله خامنه‌ای توصیف کرده. نویسنده اما بلافاصله اضافه کرده است که “برخی نیز این ابراز تشکر رهبر معظم انقلاب از زحمات تیم مذاکره‌کننده را مترادف تأیید نتیجه مذاکرات می‌دانند که این نگاه هم اشتباه است”.
هم‌زمان حسین شریعتمداری، نماینده ولی‌فقیه در موسسه کیهان و مدیرمسئول این روزنامه، در سرمقاله امروز کیهان نوشت: “بعد از بیانات رهبر معظم انقلاب و تاکید ایشان بر ضرورت بررسی دقیق متن توافق وین، معلوم شد که اگر با توافق یادشده، موافقت داشتند، تاکید ایشان بر ضرورت بررسی دقیق متن آن ضرورتی نداشت”.
پس از توافق میان ایران و اعضای گروه ۱+۵، آیت‌الله خامنه‌ای دو بار تاکید کرده است که “برای تصویب این متن، یک مسیر قانونیِ پیش‌بینی‌شده‌ای وجود دارد که باید این مسیر را طی کند و خواهد کرد”. او همچنین از به کار بردن عبارت “توافق” - آن‌گونه که اعضای دولت و حامیان روحانی از آن یاد می‌کنند - خودداری کرده و آن را “متن” توصیف می‌کند.
رهبر جمهوری‌اسلامی البته اشاره‌ای به مسیر قانونی مورد نظر خود نکرده و مشخص نیست که این مسیر باید از طریق مجلس شورای اسلامی طی شود یا در اختیار شورای عالی امنیت ملی است.
هم‌زمان حسین نقوی حسینی، عضو کمیسیون امنیت ملی و سیاست خارجی مجلس، گفت که براساس قانون “الزام دولت به حفظ دستاوردهای هسته‌ای”، متن توافق هسته‌ای باید به شکل هم‌زمان به “شورای عالی امنیت ملی و مجلس شورای اسلامی” فرستاده شود تا در کمیسیون امنیت ملی و سیاست خارجی مجلس مورد بررسی قرار گیرد و سپس به صحن علنی برود.
به گفته نقوی‌حسینی: “با توجه به اینکه ما هنوز از محتوای کامل «برجام» مطلع نیستیم و «برجام» در مراجع قانونی بررسی نشده است، نمی توان قضاوت صریحی در مورد توافق کرد… حداکثر حدود سه هفته بررسی «برجام» در مجلس به طول خواهد انجامید”.
فرمانده سپاه پاسداران نیز از جمله افرادی است که “نگرانی‌هایی” درباره توافق هسته‌ای دارد. جعفری در نماز عیدفطر خبر از آن داد که درباره نگرانی‌های خود از متن توافق با مسئولان دولتی صحبت کرده. محمدعلی جعفری با اشاره به اینکه نگرانی‌هایی درباره “جمع‌بندی مذکرات” و “پیش‌نویس قطعنامه وجود دارد”، گفت که با علی‌اکبر صالحی، رئیس سازمان انرژی اتمی “همین صحبت‌ها را می‌کردم و بخصوص در قطعنامه، نگرانی وجود دارد که امیدواریم به فضل خدا برطرف شود”.
رجانیوز، وب‌سایت نزدیک به جبهه پایداری، که از جمله اصلی ترین منتقدان گفت‌وگوهای هسته‌ای است، ضمن انتشار “خلاصه توافق نهایی در ۷ صفحه”، نوشت: “ایران در ازای چشم پوشی(طولانی مدت یا دائم) از نقاط کلیدی صنعت هسته ای(غنی سازی، تحقیق و توسعه، آب سنگین، بازفراوری) و به خطر انداختن امنیت و استقلال خود(پذیرش نظارت ها و بازرسی های گسترده آژانس و قیمومیت ۱+۵) تنها موفق به لغو بخشی از تحریمها(سازمان ملل، اتحادیه اروپا و تعدادی از فرمانهای اجرایی رئیس جمهور) و تعلیق بخش دیگری از تحریمهای اتحادیه اروپا و امریکا شده است. به عبارت دیگر ایران در عوض چشم پوشی از برخی از مهمترین حقوق خود، متقابلا بخشی از حقوق خود را دریافت کرده است یعنی هم آنچه که داده حق خود بوده و هم آنچه که گرفته حق خود بوده است”
